Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SPIDRQ14159 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SPIDRQ14159 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SPIDRQ14159 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SPIDRQ14159 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SPIDRQ14159 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SPIDRQ14159 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SPIDRQ14159 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SPIDRQ14159 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SPIDRQ14159 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SPIDRQ14159 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.89
SPIDRQ14159 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.89
SPIDRQ14159 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
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