Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 AL713998.2-201ENST00000604538 1198 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC-0.74□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.74□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC-0.75□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 AP002371.1-201ENST00000463604 433 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC-0.75□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC-0.75□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC-0.75□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 hsa-mir-550a-2.1-201ENST00000637473 97 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 AC010809.3-201ENST00000621310 641 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 AC010615.3-201ENST00000597319 394 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SPTAN1Q13813 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
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