Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
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