Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PDE3BQ13370 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PDE3BQ13370 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PDE3BQ13370 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
PDE3BQ13370 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
PDE3BQ13370 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PDE3BQ13370 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PDE3BQ13370 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PDE3BQ13370 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PDE3BQ13370 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PDE3BQ13370 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PDE3BQ13370 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PDE3BQ13370 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PDE3BQ13370 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PDE3BQ13370 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PDE3BQ13370 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PDE3BQ13370 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PDE3BQ13370 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PDE3BQ13370 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PDE3BQ13370 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PDE3BQ13370 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PDE3BQ13370 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PDE3BQ13370 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PDE3BQ13370 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PDE3BQ13370 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PDE3BQ13370 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PDE3BQ13370 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
PDE3BQ13370 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PDE3BQ13370 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PDE3BQ13370 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PDE3BQ13370 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PDE3BQ13370 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PDE3BQ13370 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PDE3BQ13370 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
PDE3BQ13370 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
PDE3BQ13370 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PDE3BQ13370 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PDE3BQ13370 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PDE3BQ13370 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PDE3BQ13370 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PDE3BQ13370 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PDE3BQ13370 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PDE3BQ13370 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PDE3BQ13370 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PDE3BQ13370 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PDE3BQ13370 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
PDE3BQ13370 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
PDE3BQ13370 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PDE3BQ13370 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PDE3BQ13370 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PDE3BQ13370 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PDE3BQ13370 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PDE3BQ13370 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PDE3BQ13370 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PDE3BQ13370 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PDE3BQ13370 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PDE3BQ13370 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PDE3BQ13370 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PDE3BQ13370 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PDE3BQ13370 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PDE3BQ13370 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PDE3BQ13370 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PDE3BQ13370 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PDE3BQ13370 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
PDE3BQ13370 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PDE3BQ13370 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PDE3BQ13370 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PDE3BQ13370 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PDE3BQ13370 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PDE3BQ13370 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PDE3BQ13370 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
PDE3BQ13370 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
PDE3BQ13370 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PDE3BQ13370 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PDE3BQ13370 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PDE3BQ13370 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PDE3BQ13370 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PDE3BQ13370 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PDE3BQ13370 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PDE3BQ13370 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PDE3BQ13370 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PDE3BQ13370 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PDE3BQ13370 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PDE3BQ13370 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PDE3BQ13370 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PDE3BQ13370 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PDE3BQ13370 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
PDE3BQ13370 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PDE3BQ13370 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
PDE3BQ13370 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PDE3BQ13370 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PDE3BQ13370 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
PDE3BQ13370 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PDE3BQ13370 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PDE3BQ13370 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PDE3BQ13370 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PDE3BQ13370 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PDE3BQ13370 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PDE3BQ13370 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PDE3BQ13370 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
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