Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RIGQ13278 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RIGQ13278 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RIGQ13278 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
RIGQ13278 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RIGQ13278 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
RIGQ13278 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
RIGQ13278 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC1.97□□□□□ -2.09
RIGQ13278 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RIGQ13278 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RIGQ13278 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RIGQ13278 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RIGQ13278 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RIGQ13278 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RIGQ13278 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
RIGQ13278 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RIGQ13278 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
RIGQ13278 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
RIGQ13278 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
RIGQ13278 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.09
RIGQ13278 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RIGQ13278 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RIGQ13278 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RIGQ13278 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RIGQ13278 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RIGQ13278 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RIGQ13278 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RIGQ13278 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RIGQ13278 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RIGQ13278 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RIGQ13278 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RIGQ13278 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RIGQ13278 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RIGQ13278 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
RIGQ13278 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
RIGQ13278 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
RIGQ13278 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RIGQ13278 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
RIGQ13278 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
RIGQ13278 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
RIGQ13278 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RIGQ13278 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RIGQ13278 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RIGQ13278 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RIGQ13278 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
RIGQ13278 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
RIGQ13278 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
RIGQ13278 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RIGQ13278 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RIGQ13278 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RIGQ13278 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RIGQ13278 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RIGQ13278 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
RIGQ13278 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
RIGQ13278 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
RIGQ13278 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
RIGQ13278 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
RIGQ13278 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RIGQ13278 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RIGQ13278 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RIGQ13278 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RIGQ13278 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC1.95□□□□□ -2.1
RIGQ13278 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RIGQ13278 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RIGQ13278 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RIGQ13278 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
RIGQ13278 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RIGQ13278 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
RIGQ13278 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RIGQ13278 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
RIGQ13278 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RIGQ13278 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
RIGQ13278 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RIGQ13278 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RIGQ13278 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RIGQ13278 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RIGQ13278 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RIGQ13278 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
RIGQ13278 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RIGQ13278 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RIGQ13278 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RIGQ13278 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RIGQ13278 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RIGQ13278 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RIGQ13278 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RIGQ13278 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC1.95□□□□□ -2.1
RIGQ13278 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RIGQ13278 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC1.95□□□□□ -2.1
RIGQ13278 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RIGQ13278 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
RIGQ13278 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
RIGQ13278 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RIGQ13278 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RIGQ13278 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RIGQ13278 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
RIGQ13278 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
RIGQ13278 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RIGQ13278 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
RIGQ13278 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
RIGQ13278 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
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