Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SEMA3FQ13275 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
SEMA3FQ13275 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SEMA3FQ13275 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SEMA3FQ13275 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SEMA3FQ13275 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SEMA3FQ13275 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SEMA3FQ13275 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SEMA3FQ13275 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SEMA3FQ13275 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SEMA3FQ13275 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SEMA3FQ13275 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SEMA3FQ13275 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SEMA3FQ13275 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SEMA3FQ13275 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SEMA3FQ13275 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SEMA3FQ13275 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SEMA3FQ13275 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SEMA3FQ13275 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SEMA3FQ13275 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SEMA3FQ13275 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SEMA3FQ13275 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SEMA3FQ13275 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SEMA3FQ13275 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SEMA3FQ13275 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SEMA3FQ13275 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SEMA3FQ13275 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SEMA3FQ13275 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SEMA3FQ13275 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SEMA3FQ13275 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SEMA3FQ13275 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SEMA3FQ13275 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SEMA3FQ13275 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
SEMA3FQ13275 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SEMA3FQ13275 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SEMA3FQ13275 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
SEMA3FQ13275 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
SEMA3FQ13275 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SEMA3FQ13275 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SEMA3FQ13275 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SEMA3FQ13275 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SEMA3FQ13275 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SEMA3FQ13275 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SEMA3FQ13275 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SEMA3FQ13275 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SEMA3FQ13275 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SEMA3FQ13275 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SEMA3FQ13275 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SEMA3FQ13275 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
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