Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 RNU6-838P-201ENST00000363399 108 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157 ms