Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.74□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC1.72□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.13
COPS7AQ9UBW8 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC1.71□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
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