Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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