Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
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PTPROQ16827 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
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PTPROQ16827 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
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PTPROQ16827 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
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PTPROQ16827 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
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PTPROQ16827 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
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PTPROQ16827 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
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PTPROQ16827 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
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