Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
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