Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GRIK4Q16099 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GRIK4Q16099 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GRIK4Q16099 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GRIK4Q16099 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
GRIK4Q16099 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GRIK4Q16099 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GRIK4Q16099 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GRIK4Q16099 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
GRIK4Q16099 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
GRIK4Q16099 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
GRIK4Q16099 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GRIK4Q16099 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
GRIK4Q16099 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
GRIK4Q16099 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
GRIK4Q16099 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
GRIK4Q16099 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
GRIK4Q16099 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GRIK4Q16099 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GRIK4Q16099 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GRIK4Q16099 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GRIK4Q16099 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GRIK4Q16099 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GRIK4Q16099 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
GRIK4Q16099 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GRIK4Q16099 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
GRIK4Q16099 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
GRIK4Q16099 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
GRIK4Q16099 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
GRIK4Q16099 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GRIK4Q16099 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GRIK4Q16099 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GRIK4Q16099 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GRIK4Q16099 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GRIK4Q16099 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
GRIK4Q16099 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
GRIK4Q16099 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
GRIK4Q16099 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
GRIK4Q16099 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
GRIK4Q16099 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GRIK4Q16099 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
GRIK4Q16099 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
GRIK4Q16099 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
GRIK4Q16099 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GRIK4Q16099 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GRIK4Q16099 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GRIK4Q16099 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GRIK4Q16099 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GRIK4Q16099 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GRIK4Q16099 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
GRIK4Q16099 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GRIK4Q16099 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
GRIK4Q16099 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GRIK4Q16099 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GRIK4Q16099 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
GRIK4Q16099 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GRIK4Q16099 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GRIK4Q16099 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
GRIK4Q16099 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GRIK4Q16099 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK4Q16099 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK4Q16099 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK4Q16099 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK4Q16099 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK4Q16099 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK4Q16099 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK4Q16099 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK4Q16099 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK4Q16099 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK4Q16099 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
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GRIK4Q16099 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
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GRIK4Q16099 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK4Q16099 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK4Q16099 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK4Q16099 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK4Q16099 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK4Q16099 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK4Q16099 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK4Q16099 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK4Q16099 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK4Q16099 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK4Q16099 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK4Q16099 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK4Q16099 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
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