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| TTF1 | Q15361 | AF228730.4-201 | ENST00000421457 | 183 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| TTF1 | Q15361 | MTCO3P29-201 | ENST00000432119 | 779 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| TTF1 | Q15361 | KRTAP13-6P-201 | ENST00000508999 | 371 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| TTF1 | Q15361 | AC010210.1-203 | ENST00000513905 | 260 nt | TSL 3 BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| TTF1 | Q15361 | LINC02545-201 | ENST00000525381 | 306 nt | TSL 3 BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| TTF1 | Q15361 | ELOCP31-201 | ENST00000540463 | 467 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
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| TTF1 | Q15361 | CTSLP2-204 | ENST00000629029 | 392 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| TTF1 | Q15361 | KTN1-203 | ENST00000395309 | 4021 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| TTF1 | Q15361 | OGN-201 | ENST00000262551 | 2971 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.93 | | |
| TTF1 | Q15361 | OR2L2-203 | ENST00000642011 | 4225 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| TTF1 | Q15361 | DENND4A-202 | ENST00000443035 | 8665 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| TTF1 | Q15361 | MIR449A-201 | ENST00000362113 | 91 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| TTF1 | Q15361 | MIR518C-201 | ENST00000384822 | 101 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| TTF1 | Q15361 | TRDJ2-201 | ENST00000390475 | 54 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| TTF1 | Q15361 | AC092423.1-201 | ENST00000430165 | 186 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| TTF1 | Q15361 | CEP57L1P1-201 | ENST00000430943 | 1201 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |