Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC3.02□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC3.02□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
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