Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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