Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
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NCAPHQ15003 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
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NCAPHQ15003 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
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NCAPHQ15003 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
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