Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.16□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
TUBA3CQ13748 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.9 ms