Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
MTMR3Q13615 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.6 ms