Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
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TUBB3Q13509 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
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TUBB3Q13509 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
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TUBB3Q13509 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
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TUBB3Q13509 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
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TUBB3Q13509 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
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TUBB3Q13509 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
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TUBB3Q13509 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
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TUBB3Q13509 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
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