Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
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