Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
SP140Q13342 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
SP140Q13342 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SP140Q13342 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SP140Q13342 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SP140Q13342 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SP140Q13342 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SP140Q13342 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SP140Q13342 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SP140Q13342 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SP140Q13342 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SP140Q13342 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SP140Q13342 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SP140Q13342 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SP140Q13342 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SP140Q13342 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
SP140Q13342 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SP140Q13342 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SP140Q13342 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SP140Q13342 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
SP140Q13342 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SP140Q13342 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SP140Q13342 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
SP140Q13342 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SP140Q13342 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SP140Q13342 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SP140Q13342 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SP140Q13342 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SP140Q13342 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SP140Q13342 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SP140Q13342 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SP140Q13342 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SP140Q13342 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SP140Q13342 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SP140Q13342 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SP140Q13342 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SP140Q13342 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SP140Q13342 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SP140Q13342 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SP140Q13342 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SP140Q13342 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SP140Q13342 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SP140Q13342 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SP140Q13342 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SP140Q13342 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SP140Q13342 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SP140Q13342 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SP140Q13342 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SP140Q13342 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SP140Q13342 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SP140Q13342 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SP140Q13342 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SP140Q13342 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SP140Q13342 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SP140Q13342 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
SP140Q13342 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
SP140Q13342 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SP140Q13342 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SP140Q13342 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
SP140Q13342 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SP140Q13342 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SP140Q13342 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SP140Q13342 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
SP140Q13342 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SP140Q13342 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SP140Q13342 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SP140Q13342 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SP140Q13342 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SP140Q13342 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SP140Q13342 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SP140Q13342 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SP140Q13342 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SP140Q13342 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
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SP140Q13342 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SP140Q13342 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SP140Q13342 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
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SP140Q13342 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SP140Q13342 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SP140Q13342 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SP140Q13342 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SP140Q13342 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
SP140Q13342 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.93
SP140Q13342 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SP140Q13342 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SP140Q13342 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SP140Q13342 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SP140Q13342 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SP140Q13342 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SP140Q13342 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SP140Q13342 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SP140Q13342 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SP140Q13342 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SP140Q13342 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SP140Q13342 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SP140Q13342 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SP140Q13342 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SP140Q13342 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SP140Q13342 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
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