Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
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