Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC1.12□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC1.12□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
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