Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
STX4Q12846 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
STX4Q12846 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
STX4Q12846 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
STX4Q12846 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
STX4Q12846 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.92□□□□□ -2.26
STX4Q12846 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
STX4Q12846 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
STX4Q12846 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
STX4Q12846 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
STX4Q12846 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
STX4Q12846 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
STX4Q12846 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
STX4Q12846 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
STX4Q12846 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
STX4Q12846 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
STX4Q12846 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC0.92□□□□□ -2.26
STX4Q12846 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
STX4Q12846 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
STX4Q12846 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
STX4Q12846 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
STX4Q12846 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
STX4Q12846 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
STX4Q12846 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
STX4Q12846 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
STX4Q12846 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
STX4Q12846 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
STX4Q12846 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
STX4Q12846 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
STX4Q12846 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
STX4Q12846 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
STX4Q12846 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
STX4Q12846 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
STX4Q12846 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
STX4Q12846 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
STX4Q12846 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
STX4Q12846 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
STX4Q12846 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
STX4Q12846 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
STX4Q12846 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
STX4Q12846 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
STX4Q12846 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
STX4Q12846 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
STX4Q12846 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
STX4Q12846 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
STX4Q12846 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
STX4Q12846 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
STX4Q12846 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
STX4Q12846 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
STX4Q12846 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
STX4Q12846 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
STX4Q12846 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
STX4Q12846 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
STX4Q12846 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
STX4Q12846 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC0.91□□□□□ -2.26
STX4Q12846 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
STX4Q12846 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
STX4Q12846 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
STX4Q12846 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
STX4Q12846 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
STX4Q12846 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
STX4Q12846 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
STX4Q12846 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
STX4Q12846 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
STX4Q12846 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
STX4Q12846 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
STX4Q12846 AC005014.3-201ENST00000605985 190 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
STX4Q12846 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
STX4Q12846 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
STX4Q12846 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
STX4Q12846 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
STX4Q12846 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
STX4Q12846 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
STX4Q12846 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
STX4Q12846 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
STX4Q12846 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
STX4Q12846 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
STX4Q12846 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
STX4Q12846 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
STX4Q12846 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
STX4Q12846 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
STX4Q12846 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
STX4Q12846 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
STX4Q12846 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
STX4Q12846 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
STX4Q12846 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
STX4Q12846 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.27
STX4Q12846 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
STX4Q12846 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
STX4Q12846 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
STX4Q12846 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
STX4Q12846 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
STX4Q12846 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
STX4Q12846 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
STX4Q12846 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
STX4Q12846 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
STX4Q12846 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
STX4Q12846 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
STX4Q12846 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
STX4Q12846 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.1 ms