Protein–RNA interactions for Protein: P28356

HOXD9, Homeobox protein Hox-D9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD9P28356 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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