Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
USP53Q70EK8 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
USP53Q70EK8 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
USP53Q70EK8 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
USP53Q70EK8 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
USP53Q70EK8 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
USP53Q70EK8 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
USP53Q70EK8 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
USP53Q70EK8 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
USP53Q70EK8 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
USP53Q70EK8 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
USP53Q70EK8 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
USP53Q70EK8 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
USP53Q70EK8 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
USP53Q70EK8 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
USP53Q70EK8 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
USP53Q70EK8 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
USP53Q70EK8 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
USP53Q70EK8 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
USP53Q70EK8 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
USP53Q70EK8 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
USP53Q70EK8 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
USP53Q70EK8 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
USP53Q70EK8 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
USP53Q70EK8 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
USP53Q70EK8 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
USP53Q70EK8 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
USP53Q70EK8 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
USP53Q70EK8 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
USP53Q70EK8 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
USP53Q70EK8 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
USP53Q70EK8 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
USP53Q70EK8 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
USP53Q70EK8 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
USP53Q70EK8 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
USP53Q70EK8 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
USP53Q70EK8 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
USP53Q70EK8 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
USP53Q70EK8 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
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USP53Q70EK8 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
USP53Q70EK8 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
USP53Q70EK8 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
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USP53Q70EK8 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
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USP53Q70EK8 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
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USP53Q70EK8 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
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USP53Q70EK8 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
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USP53Q70EK8 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
USP53Q70EK8 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
USP53Q70EK8 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
USP53Q70EK8 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
USP53Q70EK8 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
USP53Q70EK8 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
USP53Q70EK8 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
USP53Q70EK8 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
USP53Q70EK8 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
USP53Q70EK8 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
USP53Q70EK8 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
USP53Q70EK8 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
USP53Q70EK8 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
USP53Q70EK8 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
USP53Q70EK8 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
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