Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP257-201ENST00000364525 309 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 AC008957.1-203ENST00000508745 589 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP96-201ENST00000516041 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 uc_338.29-201ENST00000615099 168 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP184-201ENST00000362348 333 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 AC011853.1-201ENST00000518911 454 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
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