Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.2 ms