Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F4Q16254 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F4Q16254 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F4Q16254 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F4Q16254 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F4Q16254 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F4Q16254 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F4Q16254 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F4Q16254 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F4Q16254 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F4Q16254 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F4Q16254 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F4Q16254 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F4Q16254 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F4Q16254 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F4Q16254 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F4Q16254 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F4Q16254 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F4Q16254 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F4Q16254 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F4Q16254 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F4Q16254 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
E2F4Q16254 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
E2F4Q16254 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
E2F4Q16254 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
E2F4Q16254 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
E2F4Q16254 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
E2F4Q16254 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
E2F4Q16254 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
E2F4Q16254 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
E2F4Q16254 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
E2F4Q16254 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
E2F4Q16254 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
E2F4Q16254 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
E2F4Q16254 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
E2F4Q16254 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
E2F4Q16254 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
E2F4Q16254 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
E2F4Q16254 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
E2F4Q16254 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
E2F4Q16254 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
E2F4Q16254 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
E2F4Q16254 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
E2F4Q16254 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
E2F4Q16254 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
E2F4Q16254 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
E2F4Q16254 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
E2F4Q16254 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
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