Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KARSQ15046 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KARSQ15046 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KARSQ15046 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KARSQ15046 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KARSQ15046 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KARSQ15046 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KARSQ15046 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KARSQ15046 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
KARSQ15046 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
KARSQ15046 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KARSQ15046 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KARSQ15046 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KARSQ15046 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
KARSQ15046 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KARSQ15046 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KARSQ15046 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KARSQ15046 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KARSQ15046 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
KARSQ15046 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KARSQ15046 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KARSQ15046 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KARSQ15046 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KARSQ15046 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KARSQ15046 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KARSQ15046 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KARSQ15046 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KARSQ15046 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KARSQ15046 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
KARSQ15046 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KARSQ15046 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KARSQ15046 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KARSQ15046 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KARSQ15046 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KARSQ15046 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KARSQ15046 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KARSQ15046 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KARSQ15046 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KARSQ15046 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KARSQ15046 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KARSQ15046 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KARSQ15046 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KARSQ15046 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KARSQ15046 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KARSQ15046 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KARSQ15046 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KARSQ15046 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KARSQ15046 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KARSQ15046 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KARSQ15046 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KARSQ15046 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KARSQ15046 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KARSQ15046 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KARSQ15046 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KARSQ15046 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
KARSQ15046 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KARSQ15046 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KARSQ15046 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KARSQ15046 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KARSQ15046 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KARSQ15046 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KARSQ15046 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KARSQ15046 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KARSQ15046 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KARSQ15046 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KARSQ15046 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KARSQ15046 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KARSQ15046 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KARSQ15046 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KARSQ15046 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KARSQ15046 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KARSQ15046 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
KARSQ15046 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
KARSQ15046 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
KARSQ15046 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KARSQ15046 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KARSQ15046 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KARSQ15046 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KARSQ15046 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KARSQ15046 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KARSQ15046 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KARSQ15046 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
KARSQ15046 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KARSQ15046 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
KARSQ15046 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KARSQ15046 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
KARSQ15046 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
KARSQ15046 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
KARSQ15046 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
KARSQ15046 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
KARSQ15046 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
KARSQ15046 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
KARSQ15046 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
KARSQ15046 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
KARSQ15046 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
KARSQ15046 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
KARSQ15046 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
KARSQ15046 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
KARSQ15046 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
KARSQ15046 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
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