Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SNX17Q15036 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
SNX17Q15036 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SNX17Q15036 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SNX17Q15036 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SNX17Q15036 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SNX17Q15036 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SNX17Q15036 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SNX17Q15036 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SNX17Q15036 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
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SNX17Q15036 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
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SNX17Q15036 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
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SNX17Q15036 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
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SNX17Q15036 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SNX17Q15036 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SNX17Q15036 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SNX17Q15036 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SNX17Q15036 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
SNX17Q15036 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SNX17Q15036 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SNX17Q15036 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SNX17Q15036 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SNX17Q15036 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
SNX17Q15036 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SNX17Q15036 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SNX17Q15036 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SNX17Q15036 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SNX17Q15036 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
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SNX17Q15036 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SNX17Q15036 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
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SNX17Q15036 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
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SNX17Q15036 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SNX17Q15036 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SNX17Q15036 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SNX17Q15036 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SNX17Q15036 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SNX17Q15036 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
SNX17Q15036 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SNX17Q15036 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SNX17Q15036 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SNX17Q15036 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
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