Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
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COL19A1Q14993 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
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COL19A1Q14993 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
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COL19A1Q14993 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
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