Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CCINQ13939 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CCINQ13939 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CCINQ13939 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CCINQ13939 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CCINQ13939 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CCINQ13939 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CCINQ13939 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CCINQ13939 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CCINQ13939 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CCINQ13939 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CCINQ13939 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CCINQ13939 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CCINQ13939 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CCINQ13939 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CCINQ13939 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CCINQ13939 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CCINQ13939 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CCINQ13939 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CCINQ13939 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CCINQ13939 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CCINQ13939 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CCINQ13939 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CCINQ13939 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CCINQ13939 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CCINQ13939 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CCINQ13939 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CCINQ13939 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CCINQ13939 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CCINQ13939 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CCINQ13939 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CCINQ13939 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CCINQ13939 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CCINQ13939 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CCINQ13939 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CCINQ13939 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CCINQ13939 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CCINQ13939 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CCINQ13939 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CCINQ13939 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CCINQ13939 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CCINQ13939 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CCINQ13939 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CCINQ13939 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CCINQ13939 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
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CCINQ13939 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
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CCINQ13939 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CCINQ13939 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
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CCINQ13939 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CCINQ13939 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CCINQ13939 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CCINQ13939 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CCINQ13939 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CCINQ13939 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
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CCINQ13939 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CCINQ13939 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CCINQ13939 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
CCINQ13939 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CCINQ13939 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CCINQ13939 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
CCINQ13939 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
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CCINQ13939 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
CCINQ13939 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CCINQ13939 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
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CCINQ13939 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CCINQ13939 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CCINQ13939 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
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CCINQ13939 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CCINQ13939 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CCINQ13939 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CCINQ13939 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CCINQ13939 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
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CCINQ13939 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CCINQ13939 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CCINQ13939 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CCINQ13939 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CCINQ13939 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CCINQ13939 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
CCINQ13939 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CCINQ13939 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CCINQ13939 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CCINQ13939 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CCINQ13939 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CCINQ13939 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CCINQ13939 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CCINQ13939 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CCINQ13939 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CCINQ13939 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CCINQ13939 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CCINQ13939 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CCINQ13939 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
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