Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

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Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC0.05□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC0.05□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC0.05□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC0.05□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC0.05□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC0.04□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC0.04□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC0.04□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC0.04□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC0.04□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 MTCO3P42-201ENST00000509488 518 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 MTCO3P39-201ENST00000514812 518 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AL354696.1-201ENST00000614652 497 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.03□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC0.03□□□□□ -2.4
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