Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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