Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.9 ms