Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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FOXE3Q13461 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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