Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SP140Q13342 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SP140Q13342 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SP140Q13342 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SP140Q13342 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SP140Q13342 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SP140Q13342 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SP140Q13342 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SP140Q13342 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SP140Q13342 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SP140Q13342 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SP140Q13342 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SP140Q13342 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SP140Q13342 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SP140Q13342 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SP140Q13342 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SP140Q13342 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
SP140Q13342 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
SP140Q13342 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SP140Q13342 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SP140Q13342 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SP140Q13342 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SP140Q13342 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SP140Q13342 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SP140Q13342 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SP140Q13342 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SP140Q13342 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SP140Q13342 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SP140Q13342 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SP140Q13342 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SP140Q13342 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SP140Q13342 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SP140Q13342 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SP140Q13342 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SP140Q13342 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SP140Q13342 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SP140Q13342 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SP140Q13342 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
SP140Q13342 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SP140Q13342 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SP140Q13342 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SP140Q13342 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SP140Q13342 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SP140Q13342 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SP140Q13342 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SP140Q13342 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SP140Q13342 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SP140Q13342 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SP140Q13342 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SP140Q13342 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SP140Q13342 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SP140Q13342 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SP140Q13342 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SP140Q13342 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SP140Q13342 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SP140Q13342 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SP140Q13342 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SP140Q13342 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SP140Q13342 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SP140Q13342 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SP140Q13342 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SP140Q13342 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SP140Q13342 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SP140Q13342 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
SP140Q13342 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SP140Q13342 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
SP140Q13342 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SP140Q13342 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
SP140Q13342 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SP140Q13342 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SP140Q13342 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SP140Q13342 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SP140Q13342 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SP140Q13342 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SP140Q13342 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SP140Q13342 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SP140Q13342 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SP140Q13342 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SP140Q13342 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SP140Q13342 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SP140Q13342 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SP140Q13342 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SP140Q13342 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SP140Q13342 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SP140Q13342 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SP140Q13342 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SP140Q13342 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SP140Q13342 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SP140Q13342 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SP140Q13342 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SP140Q13342 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SP140Q13342 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SP140Q13342 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SP140Q13342 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SP140Q13342 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SP140Q13342 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SP140Q13342 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SP140Q13342 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
SP140Q13342 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SP140Q13342 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.7 ms