Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
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