Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC0.83□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC0.83□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.83□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC0.82□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC0.82□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
GRIN2BQ13224 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.2 ms