Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ECH1Q13011 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
ECH1Q13011 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ECH1Q13011 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ECH1Q13011 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ECH1Q13011 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
ECH1Q13011 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ECH1Q13011 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ECH1Q13011 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC1.3□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
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