Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SLC10A2Q12908 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.6 ms