Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
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PTPRMP28827 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PTPRMP28827 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.15□□□□□ -2.39
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PTPRMP28827 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
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PTPRMP28827 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPRMP28827 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPRMP28827 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPRMP28827 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPRMP28827 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPRMP28827 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPRMP28827 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPRMP28827 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.1□□□□□ -2.39
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PTPRMP28827 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPRMP28827 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPRMP28827 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
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