Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPREP23469 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPREP23469 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPREP23469 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPREP23469 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPREP23469 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPREP23469 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPREP23469 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPREP23469 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPREP23469 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPREP23469 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPREP23469 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPREP23469 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPREP23469 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPREP23469 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPREP23469 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPREP23469 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPREP23469 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPREP23469 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPREP23469 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPREP23469 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPREP23469 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPREP23469 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPREP23469 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPREP23469 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPREP23469 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPREP23469 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPREP23469 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPREP23469 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPREP23469 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPREP23469 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPREP23469 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPREP23469 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPREP23469 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPREP23469 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPREP23469 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPREP23469 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPREP23469 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPREP23469 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPREP23469 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPREP23469 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
PTPREP23469 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.61
PTPREP23469 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
PTPREP23469 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
PTPREP23469 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.61
PTPREP23469 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPREP23469 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPREP23469 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
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PTPREP23469 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
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PTPREP23469 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
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PTPREP23469 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPREP23469 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPREP23469 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
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PTPREP23469 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPREP23469 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
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PTPREP23469 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPREP23469 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPREP23469 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPREP23469 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPREP23469 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPREP23469 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPREP23469 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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PTPREP23469 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPREP23469 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPREP23469 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPREP23469 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPREP23469 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
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PTPREP23469 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPREP23469 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPREP23469 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPREP23469 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPREP23469 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPREP23469 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPREP23469 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPREP23469 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPREP23469 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPREP23469 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPREP23469 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPREP23469 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPREP23469 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPREP23469 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPREP23469 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPREP23469 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPREP23469 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPREP23469 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPREP23469 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPREP23469 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPREP23469 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPREP23469 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
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