Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
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USP18Q9UMW8 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
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USP18Q9UMW8 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
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USP18Q9UMW8 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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