Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR2

NLRC3, NLR family CARD domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
NLRC3Q7RTR2 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NLRC3Q7RTR2 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NLRC3Q7RTR2 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NLRC3Q7RTR2 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NLRC3Q7RTR2 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
NLRC3Q7RTR2 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
NLRC3Q7RTR2 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NLRC3Q7RTR2 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.7 ms