Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

Predictions only

Length 1,123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.5 ms