Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPRNQ16849 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPRNQ16849 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPRNQ16849 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPRNQ16849 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPRNQ16849 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPRNQ16849 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPRNQ16849 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
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PTPRNQ16849 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPRNQ16849 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPRNQ16849 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPRNQ16849 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPRNQ16849 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
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PTPRNQ16849 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPRNQ16849 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPRNQ16849 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
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PTPRNQ16849 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPRNQ16849 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPRNQ16849 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPRNQ16849 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
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PTPRNQ16849 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPRNQ16849 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
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PTPRNQ16849 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPRNQ16849 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPRNQ16849 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPRNQ16849 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPRNQ16849 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPRNQ16849 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
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PTPRNQ16849 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPRNQ16849 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPRNQ16849 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPRNQ16849 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
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PTPRNQ16849 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPRNQ16849 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPRNQ16849 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPRNQ16849 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPRNQ16849 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPRNQ16849 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
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PTPRNQ16849 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPRNQ16849 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPRNQ16849 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPRNQ16849 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPRNQ16849 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPRNQ16849 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPRNQ16849 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPRNQ16849 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
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