Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102 ms