Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
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