Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SKIV2LQ15477 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SKIV2LQ15477 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SKIV2LQ15477 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SKIV2LQ15477 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SKIV2LQ15477 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SKIV2LQ15477 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SKIV2LQ15477 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SKIV2LQ15477 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SKIV2LQ15477 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SKIV2LQ15477 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SKIV2LQ15477 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SKIV2LQ15477 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SKIV2LQ15477 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SKIV2LQ15477 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SKIV2LQ15477 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SKIV2LQ15477 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SKIV2LQ15477 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SKIV2LQ15477 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SKIV2LQ15477 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SKIV2LQ15477 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SKIV2LQ15477 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SKIV2LQ15477 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SKIV2LQ15477 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SKIV2LQ15477 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SKIV2LQ15477 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SKIV2LQ15477 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SKIV2LQ15477 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SKIV2LQ15477 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SKIV2LQ15477 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SKIV2LQ15477 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SKIV2LQ15477 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SKIV2LQ15477 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SKIV2LQ15477 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SKIV2LQ15477 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SKIV2LQ15477 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SKIV2LQ15477 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SKIV2LQ15477 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SKIV2LQ15477 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SKIV2LQ15477 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SKIV2LQ15477 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SKIV2LQ15477 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SKIV2LQ15477 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
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